في عام 2029، أصبحت مدينة نيهاما مدينة متقدمة من الناحية التكنولوجية. بفضل التحسينات الكبيرة في علم التحكم الآلي، أصبح مواطنوها قادرين على استبدال أطرافهم بأجزاء روبوتية. لقد أصبح العالم الآن أكثر ترابطًا من أي وقت مضى، وأصبح قسم الأمن العام رقم 9 بالمدينة مسؤولاً عن مكافحة الفساد والإرهاب والتهديدات الخطيرة الأخرى في أعقاب هذا التحول نحو العولمة.
يقود الرائد قوي الإرادة موتوكو كوساناجي من القسم 9 قضية تتعلق بهاكر غامض يُعرف فقط باسم “سيد الدمى”، والذي يترك وراءه سلسلة من الضحايا مجردين من ذكرياتهم. مثل العديد من الأشخاص في هذا العالم المستقبلي، فإن جسد سيد الدمى آلي بالكامل تقريبًا، مما يمنحهم قوة لا تصدق.
بينما تتبع موتوكو ومرؤوسوها مسار المجرم الغامض،وتبدأ أطراف أخرى —بما في ذلك المادة 6— بالتدخل، مما يجبرها على مواجهة الطبيعة المعقدة للغاية للقضية. أثناء تفكيرها في أسئلة فلسفية مختلفة، مثل معنى حياتها، سرعان ما أدركت موتوكو أن الشخص الذي سيقدم هذه الإجابات ليس سوى سيد الدمى نفسه.